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L’intelligence artificielle pour prédire l’émergence de nouveaux variants de SARS-CoV2 ?!
7 août 2023
Les interactions entre les
protéines de l’hôte et les protéines du pathogène conditionnent l’évolution des
interactions hôte-pathogène et l’évolution des agents pathogènes. Dans cette
étude, un outil d’intelligence artificielle (UniBind) a été proposé pour
représenter les protéines sous la forme d’un graphique moléculaire. Cet outil
intègre la structure tridimensionnelle des protéines et leur affinité de
liaison. Appliqué aux variants de SARS-CoV2, Unibind a été capable de prédire
de manière efficace et évolutive les effets des variantes de protéines de
pointe du SARS-CoV-2 sur leurs affinités de liaison au récepteur ACE2 humain,
ainsi qu'aux anticorps monoclonaux neutralisant le SARS-CoV-2. Dans une analyse
inter-espèces, UniBind pourrait être utilisé pour prédire la susceptibilité de
l’hôte aux variants du SARS-CoV2.
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Scientific reference
Guangyu Wang et al. Deep-learning-enabled protein-protein interaction analysis for prediction of SARS-CoV-2 infectivity and variant evolution. Nat Med. 2023 Jul 31.
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