Patients jeunes sans comorbidité et sévérité de la Covid-19 : une signature génique via l’intelligence artificielle?
18 novembre 2021
Les déterminants moléculaires et génétiques des formes graves de Covid-19, en particulier des syndromes de détresse respiratoire aigüe (SDRA) liés au SARS-CoV-2, ne sont pas strictement établis à ce jour, notamment chez des patients jeunes et sans comorbidité. En d’autres termes, l’état des connaissances actuelles ne permet pas de préciser les raisons pour lesquelles certains de ces patients sans
Les déterminants moléculaires et génétiques des formes
graves de Covid-19, en particulier des syndromes de détresse respiratoire aigüe (SDRA)
liés au SARS-CoV-2, ne sont pas strictement établisà ce jour, notamment chez des patients jeunes et sans comorbidité.
En d’autres termes, l’état des connaissances actuelles ne permet pas de
préciser les raisons pour lesquelles certains de ces patients sans facteur de
risque évident vont présenter une défaillance sévère justifiant une prise en
charge invasive en réanimation.
Des travaux réalisés par des chercheurs français (Inserm,
Université de Strasbourg U1109, cliniciens chercheurs des Hôpitaux Universitaires
de Strasbourg), ont mis en évidence une signature génique identifiant, parmi
ces patients, ceux évoluant vers une forme critique de la maladie. L’étude
a été menée en collaboration avec l’institut d’intelligence artificielle à
Boston. Les résultats sont publiés dans la revue Science Translational
Medicine.
Les patients inclus étaient âgés de moins de 50 ans,
et sans comorbidité majeure : 47 patients étaient dits critiques,
hospitalisés en réanimation et bénéficiant d’un support ventilatoire mécanique
pour SDRA ; 25 patients étaient dits non critiques, hospitalisés en
secteur conventionnel pour une infection à SARS-CoV-2. Vingt-deux individus
dits contrôles, en bonne santé, ont également été inclus. Une analyse «multi-omique» a été réalisée, combinée aux
techniques de l’intelligence artificielle. Cette analyse était d’ordre génomique (séquençage
du génome total), transcriptomique (séquençage de l'ARN total issu de la
transcription du génome), protéomique (cellules mononucléées), immunologique,
virologique.
Les patients critiques présentaient un état inflammatoire
exacerbé, des anomalies des lignées lymphoïdes et myéloïdes, une
hypercoagulation, avec confirmation d’un «orage cytokinique». Parmi les
gènes différentiellement exprimés, il a été observé une surexpression de la
métalloprotéase ADAM9. Cette signature génique a été validée dans une seconde
cohorte indépendante de 81 patients critiques et 73 patients guéris de la Covid-19,
et a été confirmée au niveau transcriptionnel et protéique. Par ailleurs, l'inhibition
ex vivo d'ADAM9 dans des cellules épithéliales pulmonaires d’origine humaine
a diminué la charge virale et la réplication du SARS-CoV-2 dans ces cellules.
ADAM9 pourrait donc être un marqueur pronostique de l’infection à
SARS-CoV-2, mais aussi une potentielle cible thérapeutique.
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Référence scientifique
R. Carapito et al., Identification of driver genes for critical forms of COVID-19 in a deeply phenotyped young patient cohort. Sci Transl Med. 2021 Oct 26
